इलेक्ट्रोफोरेसिस प्रणालीमा दुई मुख्य कम्पोनेन्टहरू हुन्छन्: एक विद्युत आपूर्ति र एक इलेक्ट्रोफोरेसिस चेम्बर। विद्युत आपूर्तिले शक्ति आपूर्ति गर्दछ। "शक्ति," यस अवस्थामा, बिजुली हो। विद्युत आपूर्तिबाट आउने बिजुली एक दिशामा, इलेक्ट्रोफोरेसिस चेम्बरको एक छेउबाट अर्कोतिर बग्छ। च्याम्बरको क्याथोड र एनोडले विपरीत चार्ज गरिएका कणहरूलाई आकर्षित गर्दछ।
इलेक्ट्रोफोरेसिस चेम्बर भित्र, एक ट्रे हो - अझ सटीक रूपमा, एक कास्टिङ ट्रे। कास्टिङ ट्रेमा निम्न भागहरू हुन्छन्: गिलास प्लेट जुन कास्टिङ ट्रेको तलतिर जान्छ। जेल कास्टिङ ट्रे मा राखिएको छ। "कंघी" यसको नाम जस्तै देखिन्छ। कङ्घीलाई कास्टिङ ट्रेको छेउमा स्लटहरूमा राखिन्छ। यसलाई तातो, पग्लिएको जेल हाल्नु अघि स्लटहरूमा राखिन्छ। जेल बलियो भएपछि, कंघी बाहिर निकालिन्छ। कंघीको "दाँत" ले जेलमा सानो प्वाल छोड्छ जसलाई हामी "इनार" भन्छौं। इनारहरू बनाइन्छ जब तातो, पग्लिएको जेल कंघीको दाँत वरिपरि बलियो हुन्छ। जेल चिसो भएपछि कुवाहरू छोडेर कंघी बाहिर निकालिन्छ। इनारहरूले तपाईंले परीक्षण गर्न चाहनुभएको कणहरू राख्नको लागि ठाउँ प्रदान गर्दछ। कणहरू लोड गर्दा जेलमा बाधा नपर्ने व्यक्ति धेरै सावधान हुनुपर्छ। क्र्याकिङ, वा जेल तोड्ने सम्भावनाले तपाइँको नतिजाहरूलाई असर गर्नेछ।